目前开通的线路中，一号线和机场线都经过高淳区。 一号线：从新街口站往中华门方向，在张府园站下车，3号出口出门，步行约12分钟到达玄武湖隧道南站，搭乘由南京东站开往高淳的机场线大巴（全程高速），45分钟左右可抵达。 机场线：从南京南站往溧水方向，在经天路地铁站下，搭乘由南京南站至高淳的机场班车，约1小时10分左右能抵达。
根据计划，今年将要开工建设的5条线路中有两条会进入高淳区，分别是6、7号线。其中，6号线西起雨花台区金叶花园，东止栖霞区马群花园，途经南京市主城区和江宁经济技术开发区，全长约32.9公里，设20座车站；7号线北起仙霞西路，南止吉印大道，途径江宁区、建邺区和鼓楼区，全长约35.3公里，设28座车站。
这两条线路都在建设当中，通车时间尚未确定。 有网友通过人民网领导留言板咨询关于宁高城际（南京至高淳）的进展，南京市人民政府办公厅给出了最新的答复。 宁高城际是市政府确定的近期启动城市轨道交通建设的项目之一，目前已完成工程可行性研究报告编制等前期工作，正在开展施工图设计，计划于今年开工建设，2022年建成通车。
卞芯蕊优质答主南京地铁2号线西延线是南京地铁2号线的延伸线路。线路工程起于马群站，主要沿地面敷设，下穿太岗路后沿绕城公路南侧向东转入金马路向南，下穿绕城公路和玄武湖后终点止于马群站。线路全长5.375公里，全为地下线，共设置4座地下站。线路在金马路东侧设金马路停车场一座。设3座换乘站，与规划 6 号线在金马路站换乘，与既有 2 号线在马群站换乘，与规划 12 号线在油坊桥站换乘。马群站已于2014年12月28日随 2 号线西延开通试运营，规划的金马路站、廖家巷站、油坊桥站未建。
南京地铁5号线（南京地铁S5号线）是南京地铁在建的一条线路，工程线路全长约37.4公里，均为地下线，共设地下车站30座，线路起自江宁区禄口国际机场，途经江宁区、秦淮区、鼓楼区，于栖霞区仙林湖站结束。建成后将缓解南京主城的交通压力，促进南京整体发展。5号线是一条纵贯市区的线路，途经多个人员密集区，是一条年轻、活跃且客流强度极大的线路。目前在建中，预计2022年建成通车。
南京地铁10号线是南京地铁已开通运营的一条线路之一，于2014年5月28日贯通试运营，该线一期工程东起雨花台区的安德门站，西至浦口区的雨山路站，途经南京主城秦淮区和建邺区，横跨长江，进入江北新区的浦口区，是南京第一条过江地铁线路。二期工程在既有10号线的基础上，南起安德门站，北至幕府西路站，全线均为地下线，共设车站5座。
规划的南京地铁9号线是南京轨道交通线网中市域线，是连接新庄与南京站、河西地区的横向大动脉，设计时速100km/h。线路起于河西新城，向东沿江山大街、绿博园、扬子江大道、建宁西路、热河路、中山北路、中央路、龙蟠路、环陵路走行，下穿青龙山后终于曹后村。线路长32.8km，设站26座，平均站间距1.26km。
根据目前计划，宁高线二期(翔宇路南站—高淳)力争2019年开通。
